近(jìn)日(rì),中國(guó)工(gōng)程院院士、廣東(dōnα&§g)省科(kē)學院微(wēi)生(shēng)物(wù)研究所名譽所長(ch♥↑λáng)吳清平團隊完成了(le)白(bái)肉靈芝的(de)全基因組測序∏₩≠。據悉,這(zhè)是(shì)世界上(shànγ↔σg)首次對(duì)白(bái)肉靈芝的(de)基因組進行(xíng)組α∏裝和(hé)注釋。相(xiàng)關研究發表于《γ®©G3:基因,基因組,遺傳學》。
白(bái)肉靈芝是(shì)在中國(guó)發現(xiπβàn)的(de)靈芝科(kē)一(yī)新種,具有(yǒu)多¥∞π£(duō)種藥理(lǐ)活性。作(zuò)為(÷✔♠×wèi)我國(guó)具有(yǒu)鮮明(mín∞↕g)地(dì)域特色的(de)野生(shēng)資源,白(bái)肉靈芝目前已÷γΩ™成為(wèi)科(kē)技(jì)扶貧和(hé)帶動一(yī)方經濟發 ×展的(de)重要(yào)資源,在中國(guó)西(xī)南(ná←•♠n)地(dì)區(qū)廣泛種植。但(dàn)由于缺乏參δ↓↓考基因組,其遺傳研究受到(dào)了(le)阻礙。
研究人(rén)員(yuán)從(cón♣>®g)一(yī)個(gè)單核菌株中提取了(le)高(g★ ∞āo)質量的(de)DNA,并基于Illumina和(hé)∏↔"✔Nanopore平台組裝完成第一(yī)個(gè)白(bá™$¥↕i)肉靈芝全基因組。組裝的(de)基因組大(dà)小(xiǎo)♠為(wèi)50.05Mb,N50為(wèi)3.06Mb,×±✘$預測到(dào)78206條編碼序列和(hé)13390個(gè)基因。
此外(wài),研究人(rén)員(yuán)分(fēn)析了(le)白(báπ&₩ i)肉靈芝和(hé)靈芝之間(jiān)次級代謝(xiè)産物(wù)(萜類化≈♥©(huà)合物(wù))的(de)功能(néng)基因的(ε≥✔de)差異。研究發現(xiàn),與靈芝相(x π↕πiàng)比,白(bái)肉靈芝具有(yǒu)更多(σ₽≠₽duō)與萜類化(huà)合物(wù)合成相(xiàng)↔ σγ關的(de)基因,這(zhè)可(kě)能(néng)是(shì)"÷它們表現(xiàn)出不(bù)同生(shēng)物(wù)£π•↓活性的(de)原因之一(yī)。
據吳清平團隊成員(yuán)胡惠萍介紹,白(bái)肉靈芝基因€∏ 組是(shì)目前組裝質量最好(hǎo)的¶ (de)靈芝屬物(wù)種。該成果為(wèi)今後特定物•♥δ≥(wù)種的(de)高(gāo)原适應性深$★↔→層研究奠定了(le)基礎。
文(wén)章(zhāng)來(lái)源:中×✘→國(guó)科(kē)學報(bào) 作(<φzuò)者:朱漢斌 李誠斌